本發(fā)明屬于酶、核酸或微生物的測(cè)定或檢驗(yàn)方法，具體涉及一種與豬肌肉中2-乙?；?3-甲基吡嗪含量相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用

背景技術(shù)：

1、肉類是食用價(jià)值很高的食品，隨著生活水平的提高，人們對(duì)肉產(chǎn)品的需求不僅僅局限于數(shù)量，品質(zhì)及風(fēng)味已經(jīng)成為影響消費(fèi)者需求的重要因素。肉產(chǎn)品中包含的部分揮發(fā)性化合物與肉品質(zhì)風(fēng)味高度相關(guān)，是形成肉原始風(fēng)味的基礎(chǔ)，能夠賦予其特有的香氣。

2、2-乙酰基-3-甲基吡嗪屬于揮發(fā)性化合物中的吡嗪類，具有堅(jiān)果和烤面包的香氣，常用于食品工業(yè)中作為香料添加劑，尤其是在咖啡、巧克力和堅(jiān)果風(fēng)味的產(chǎn)品中。由于其獨(dú)特的香氣特性，在香水和香料的合成中也被廣泛使用。吡嗪類化合物具有抗氧化特性，能夠清除自由基，從而對(duì)細(xì)胞具有保護(hù)作用。此外，有研究顯示香氣化合物對(duì)神經(jīng)系統(tǒng)有影響，可能通過嗅覺通路影響情緒和行為。作為一種重要的有機(jī)化合物，2-乙?；?3-甲基吡嗪在食品和香料行業(yè)具有廣闊的應(yīng)用前景，其生物學(xué)作用和機(jī)制也具有重要的研究?jī)r(jià)值。

3、采用傳統(tǒng)育種方法對(duì)增加豬肉中2-乙酰基-3-甲基吡嗪的含量很難起到作用，所以豬肉中2-乙?；?3-甲基吡嗪含量的提升空間仍然很大。目前，分子標(biāo)記輔助育種技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于畜禽領(lǐng)域新品種的培育，并且通過全基因組關(guān)聯(lián)分析，可獲得與目標(biāo)性狀緊密相關(guān)的分子標(biāo)記。利用分子標(biāo)記對(duì)目標(biāo)性狀進(jìn)行早期選擇，能夠極大程度的節(jié)省育種成本并加快遺傳進(jìn)展。然而，目前沒有與豬肉中2-乙?；?3-甲基吡嗪含量相關(guān)的分子標(biāo)記。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是提供與豬肌肉中2-乙?；?3-甲基吡嗪含量相關(guān)的分子標(biāo)記。所要解決的技術(shù)問題不限于所描述的技術(shù)主題，本領(lǐng)域技術(shù)人員通過以下描述可以清楚地理解本文未提及的其它技術(shù)主題。

2、為解決上述技術(shù)問題，本發(fā)明提供了以下技術(shù)方案：

3、本發(fā)明提供檢測(cè)豬基因組中snp位點(diǎn)的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)的應(yīng)用，所述snp位點(diǎn)為seq?id?no:1的第134位核苷酸，其核苷酸種類為a或g，所述為如下任一中的應(yīng)用，

4、a1）所述物質(zhì)在檢測(cè)或輔助檢測(cè)2-乙?；?3-甲基吡嗪含量中的應(yīng)用；

5、a2）所述物質(zhì)在檢測(cè)或輔助檢測(cè)snp的多態(tài)性或基因型中的應(yīng)用；

6、a3）所述物質(zhì)在豬育種中的應(yīng)用；

7、a4）所述物質(zhì)在制備檢測(cè)或輔助檢測(cè)2-乙酰基-3-甲基吡嗪含量的產(chǎn)品中的應(yīng)用；

8、a5）所述物質(zhì)在制備檢測(cè)或輔助檢測(cè)snp的多態(tài)性或基因型的產(chǎn)品中的應(yīng)用；

9、a6）所述物質(zhì)在制備豬育種的產(chǎn)品中的應(yīng)用。

10、所述snp也是位于豬基因組（sscrofa11.1，gcf_000003025.6）的9號(hào)染色體上第6328556位核苷酸（對(duì)應(yīng)于核苷酸序列seq?id?no:1的第134位核苷酸）。

11、本領(lǐng)域技術(shù)人員知曉，seq?id?no:1是snp位點(diǎn)（seq?id?no:1的第134位核苷酸）及其附近的核苷酸序列組成，snp位點(diǎn)附近的核苷酸序列的多少不應(yīng)當(dāng)作為本發(fā)明保護(hù)范圍的限定因素，其可以是snp位點(diǎn)前后25?bp、50?bp、70?bp、100?bp、150?bp、200?bp、300?bp、400?bp、500?bp、600?bp、700?bp、800?bp、900?bp、1000?bp，也可以是其他任意值，其作用在于輔助定位snp在豬基因組的6號(hào)染色體上的位置。

12、本文中所述前后應(yīng)當(dāng)是以本領(lǐng)域技術(shù)人員公認(rèn)的方向來定義的前或后，如5'-3'方向。

13、本發(fā)明還提供檢測(cè)或輔助檢測(cè)2-乙?；?3-甲基吡嗪含量的方法，包括如下步驟：檢測(cè)待測(cè)豬中前述snp位點(diǎn)的基因型，根據(jù)所述基因型檢測(cè)或輔助檢測(cè)2-乙?；?3-甲基吡嗪含量。

14、上述檢測(cè)或輔助檢測(cè)2-乙?；?3-甲基吡嗪含量的方法，所述snp的基因型為aa的待測(cè)豬的2-乙?；?3-甲基吡嗪相對(duì)含量顯著高于基因型為ag和gg的待測(cè)豬，基因型為ag的待測(cè)豬的2-乙酰基-3-甲基吡嗪相對(duì)含量顯著高于基因型為gg的待測(cè)豬。所述aa是所述snp位點(diǎn)為a的純合型，所述ga是所述snp位點(diǎn)為g和a的雜合型，所述gg是所述snp位點(diǎn)為g的純合型。

15、上述應(yīng)用或方法中，所述檢測(cè)或輔助檢測(cè)2-乙酰基-3-甲基吡嗪含量具體可為檢測(cè)豬背最長(zhǎng)肌中的2-乙?；?3-甲基吡嗪含量。

16、上述方法中，可通過pcr擴(kuò)增豬基因組中含有前述snp的部分區(qū)域。如對(duì)含有seqid?no:1的pcr產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序，檢測(cè)seq?id?no:1的第134位脫氧核糖核苷酸類型，以檢測(cè)待測(cè)豬基因組中所述snp位點(diǎn)的基因型。

17、本發(fā)明還提供一種豬育種的方法，所述方法包括檢測(cè)待測(cè)豬基因組中前述snp位點(diǎn)的基因型，選擇所述snp位點(diǎn)的基因型為aa的待測(cè)豬作為親本進(jìn)行育種，所述aa是所述snp位點(diǎn)為a的純合型。

18、本發(fā)明還提供含有檢測(cè)豬基因組中snp位點(diǎn)的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)的產(chǎn)品，所述snp位點(diǎn)為seq?id?no:1的第134位核苷酸，其核苷酸種類為a或g；所述產(chǎn)品為下述任一種：

19、b1）用于備檢測(cè)或輔助檢測(cè)2-乙?；?3-甲基吡嗪含量的產(chǎn)品；

20、b2）用于檢測(cè)或輔助檢測(cè)snp的多態(tài)性或基因型的產(chǎn)品；

21、b3）用于豬育種的產(chǎn)品。

22、上述應(yīng)用或產(chǎn)品中，所述物質(zhì)為下述任一種：

23、c1）所述物質(zhì)為擴(kuò)增包括所述snp位點(diǎn)在內(nèi)的豬基因組dna片段的引物組合物；

24、c2）所述物質(zhì)為含有c1）所述引物組合物的pcr試劑；

25、c3）所述物質(zhì)為含有c1）所述引物組合物或c2）所述pcr試劑的試劑盒。

26、所述試劑盒還可包括pcr擴(kuò)增的常規(guī)試劑。所述試劑盒還可包括測(cè)序常規(guī)試劑。

27、上述應(yīng)用或產(chǎn)品中，所述引物組合物為f1）-f3）中任一項(xiàng)：

28、f1）、由序列表中seq?id?no:2所示的單鏈dna和序列表中seq?id?no:3所示的單鏈dna組成的引物組；

29、f2）、由核苷酸序列是序列表中seq?id?no:1的第1-20位的單鏈dna和核苷酸序列是序列表中seq?id?no:1的第220-239的單鏈dna組成的引物組；

30、f3）、由將seq?id?no:2經(jīng)過一個(gè)或幾個(gè)核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與seq?id?no:2具有相同功能的單鏈dna和由將seq?id?no:3經(jīng)過一個(gè)或幾個(gè)核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與seq?id?no:3具有相同功能的單鏈dna組成的引物組。

31、本發(fā)明還提供前述產(chǎn)品在豬育種中的應(yīng)用。

32、本發(fā)明還提供一種dna分子，所述dna分子的一條鏈為seq?id?no:1。

33、本發(fā)明還提供一種dna分子的應(yīng)用，所述dna分子的一條鏈的核苷酸序列為seq?idno:1，所述應(yīng)用為下述任一種：

34、d1）所述dna分子在檢測(cè)或輔助檢測(cè)2-乙酰基-3-甲基吡嗪含量；

35、d2）所述dna分子在檢測(cè)或輔助檢測(cè)snp的多態(tài)性或基因型；

36、d3）所述dna分子在豬育種；

37、d4）所述dna分子在制備檢測(cè)或輔助檢測(cè)2-乙?；?3-甲基吡嗪含量的產(chǎn)品；

38、d5）所述dna分子在制備檢測(cè)或輔助檢測(cè)snp的多態(tài)性或基因型的產(chǎn)品；

39、d6）所述dna分子在制備豬育種的產(chǎn)品。

40、本發(fā)明還保護(hù)以上任一所述方法在育種中的應(yīng)用。

41、本發(fā)明還保護(hù)所述特異引物在育種中的應(yīng)用。

42、本發(fā)明還保護(hù)所述試劑盒在育種中的應(yīng)用。

43、本發(fā)明還保護(hù)所述引物組合物。

44、以上任一所述育種為豬育種。

45、所述育種的目的為選育背最長(zhǎng)肌2-乙酰基-3-甲基吡嗪含量高的個(gè)體。

46、所述育種的目的為選育背最長(zhǎng)肌2-乙?；?3-甲基吡嗪含量高的群體。

47、所述育種的目的為選育背最長(zhǎng)肌2-乙?；?3-甲基吡嗪含量高的品種。

48、所述育種中，淘汰ag基因型和gg基因型的個(gè)體。

49、所述育種中，保留aa基因型的個(gè)體。

50、以上任一所述豬為所有豬品種。

51、本發(fā)明的有益效果為：本發(fā)明的snp分子標(biāo)記與豬背最長(zhǎng)肌2-乙?；?3-甲基吡嗪含量性狀相關(guān)，是一個(gè)新的分子標(biāo)記，通過確定待測(cè)豬snp位點(diǎn)的基因型對(duì)豬背最長(zhǎng)肌2-乙酰基-3-甲基吡嗪含量性狀進(jìn)行早期選擇，能夠節(jié)省生產(chǎn)成本，提升肉品質(zhì)風(fēng)味并加快遺傳進(jìn)展，更好地服務(wù)于豬的育種，具有很大的經(jīng)濟(jì)應(yīng)用價(jià)值和科研價(jià)值。